ต้นมะพร้าวเป็นเหมือนพืชใบเลี้ยงเดี่ยวทั่วๆไปคือไม่มีรากแก้วแต่มีรากเส้นใหญ่ๆเส้นผ่าศูนย์กลางประมาณ1 ซ.ม. ออกไปจากโคนต้นโดยตรงเรียกว่า
รากใหญ่ (Main Root ) รากใหญ่มีความยาว 3– 20 เมตร เมื่อแรกงอกออกจากลำต้นจะมีสีเหลืองอ่อนต่อมาเปลี่ยนเป็นสีแดงและสีน้ำตาลแดงตามลำดับต้นมะพร้าว
จะผลิตรากใหญ่ออกมาเรื่อยๆเพื่อทดแทนรากเดิมที่ตายไปต้นมะพร้าวแต่ละต้นจะมีรากใหญ่อยู่ถึง 2,500 ถึง 3,000 รากหน้าที่ของรากใหญ่นี้มีหน้าที่
ลำเลียงอาหารเข้าสู่ลำต้นมากกว่าดูดอาหารโดยตรง เพราะรากใหญ่ห่อหุ้มด้วยเส้นใยซึ่งน้ำซึมผ่านเข้าไปภายในรากไม่ได้ มีเฉพาะส่วนซึ่งอยู่ติดกับปลอกราก
ตรงปลายสุดของรากที่เป็นส่วนที่บอบบาง น้ำและอาหารซึมผ่านเข้าไปได้ บนรากใหญ่จะมีรากที่ทำหน้าที่หายใจเรียกว่า Pneumatophores
รากสาขา เป็นรากที่แตกแขนงออกไปจากเส้นรากใหญ่และแตกแขนงออกไปเรื่อยๆรากเหล่านี้แผ่กระจายออก
ไปตามดินชั้นต่างๆเพื่อดูดน้ำและแร่ธาตุมายังรากใหญ่และลำเลียงเข้าสู่ต้นรากมะพร้าวนอกจากมีหน้าที่ดูดน้ำและ
แร่ธาตุแล้วยังมีหน้าที่ยึดเหนี่ยวลำต้นมิให้โค่นล้ม
ประโยชน์ของรากมะพร้าว
แก้ไข้อาการ ท้องเสีย แก้ไข้อาการรากสาด แก้พิษไข้ แก้อาการสันนิบาต แก้อาการอุจจาระพิการ แก้ท้องเสีย ร้อนใน กระหายน้ำ แก้ปากเปื่อย โดยใช้วิธีการต้มและอ้มไว้ในปาก